گرفتن سند تک برگ چگونه باید انجام شود؟

با سلام
خونه ما که ۵۰ ساله به اسم پدرم بوده البته توی سند سوم نفری بوده که خریداری کرده سال ۹۳ وکالتی به اسم من و برادرم کرد سند منگوله دار بود بعد جهت گرفتن سند تک برگ رفتیم اداره ثبت .پشت خونمون مدرسه هستش و یه خونه دیگه جی پی اس زدن دیدن که مدرسه ۶۰ سانت از ما برده ما هم یک متر و هفت سانت از مدرسه ولی بعد فهمیدن که ما از زمین مدرسه نبردیم قبلنا این زمینا باغ بوده و جوی آب از بینشون رد میشده و صاحب اصلی زمین هم حق آب داشته هم طبق تقسیم نامه موجود در دفتر ثبت اسناد و نوشته سند جز و سهم اختصاصی مالک بوده ثبت اسناد ما رو به شهرداری فرستاد و شهرداری هم به املاک شهرداری و مدیریت حقوقی شهرداری هم نظرش بر اینه که ما باید پول زمینی که در اشتباه ساخت بدلیل نبودن امکانات مهندسی در اون زمان و ذوزنقه بودن زمین بوجود اومده باید به قیمت روز به شهرداری بپردازیم تا بلامانع برامون صادر کنه الان اینجا قیمت روز زمین ۱۰ میلیون هستش و مساحتی که ما داخل جوی آب پشت خونه رفتیم که متروکه بوده و مدرسه و خانه پشتی هم چسبیده به خونه ما هستش و اونا هم یه مقداری از اون جوی بردن به مساحت ۳متر یعنی سی میلیون باید پرداخت کنیم که بلامانع رو بگیریم مام خیلی وضع پولی بدی داریم آیا برای ما چاره ای هست یا نه و سوال اینکه چطوری قدیما شهرداری مجوز ساخت داده و ثبت اسناد هم بهش سند داده مگه قدیما کارشناس نمیفرستادن