برداشتن سقف پاسیو و عدم نصب مجدد آن موجب میشود تا سند رسمی به نام خریدار نشود؟

سلام (با توجه به نزدیکی معامله تسریع جواب موجب امتنان و تشکر بیکران است )؛ خسته نباشید یکم طولانیه ولی حتما حوصله خواهید نمود:
در تاریخ ۳/۳/۹۵ مبایعه نامه ای تنظیم نمودم برای خرید آپارتمان در طبقه همکف ، کل ثمن ۴۴۰ میلیون که طبق توافق ۳۰۰ میلیون چک روز دادم و پاس شد و طبق توافق مبایعه نامه کلید گرفتم ،قرار شد در تاریخ ۳/۵/۹۵ مبلغ ۱۴۰ میلیون تومان نیز پرداخت بشه و سند در دفترخانه منتقل شود ، ضمناً خسارت تاخیر هم قید شده ؛ صاحبخانه به جهت اخذ پایان کار جدید آپارتمان؛اقدام به تخریب سقف پاسیو (که هنگام معامله وجود داشته و مورد تایید شاهدین هست لیکن در قرارداد مسقف بودن آن ذکر نشده)نموده و الان سقف را مرمت نمینماید و هزینه ای نیز کم نمیکند؛ از طرفی بنگاه در مفاد قرارداد بجای اینکه ذکر کند مبلغ ۱۴۰ میلیون تومان در تاریخ ۳/۵/۹۵ از طرف خریدار به فروشنده پرداخت میگردد؛ اشتباها به نفع من نوشته : مبلغ ۱۴۰ میلیون نقداً فی المجلس در تاریخ 3/5/۹۵ به فروشنده پرداخت گردید، که فروشنده نیز امضاء نموده؛ حال امید فروشنده مراجعه به دفترخانه و گرفتن عدم حضور بنده است ؛ آیا میشه من به استناد آن در دفترخانه حاضر شم وادعا پرداخت کل ثمن معامله را نمایم (و ایشان ملک را به نام نزند) و بنده عدم حضور بگیرم و دادخواست الزام به تنظیم سند بگیرم؟ یا در مرحله الزام به سند با قاضی به مشکل خواهم خورد؟