آیا دفتر اسناد رسمی می تواند رای دادگاه را اجرا نکند؟

ما ملکی را در سال ۱۳۹۰ پیش خرید کرده بودیم که مبایعه نامه دستی در مشاور املاک تنظیم شد که فروشنده طبقه ۳ را به ما فروخت
اما هنگامی که ملک آماده شد واحد ۳ را به سازنده داد و طبقه اول را به ما داد
مبایعه نامه کد رهگیری داری که ما گرفتیم در آن فقط متراژ و پلاک ثبت شده و طبقه و واحد قید نشده است ما درخواست الزام به سند دادیم و در دادگاه بصورت کامل قاضی موضوع را بررسی و در نهایت حکم به نفع ما صادر شد و فروشنده ملزم به انتقال سند شد که فروشنده حاضر به انتقال نشد و دادگاه ما را به دفتر اسناد رسمی ارجاع داد
حالا که به بحث انتقال سند رسیده ایم سر دفتر دار ایراد گرفته که طبقه سوم اینجا مطرح است نه طبقه اول
در صورتیکه قاضی با اشراف کامل به این موضوع حکم نهایی را صادر کرده است
آیا ایشان می تواند حکم دادگاه را اجرا نکند؟؟ ؟